root+瘦身後的備份與還原

各位大大
我用的手機是小米3,版本10.0+root+瘦身(刪掉一些不必要的APK)
我想請問的是
如果官方有新的版本出來
我把手機連接電腦做了備份
接下來我再升級到官方的最新版本+3清
那這樣我在還原之前的備份這樣會有FC的狀況發生嗎?
因為畢竟有瘦身了~
或是有更好更快速的備份方式嗎??
謝謝大家

還原備份不會將升級後的手機內[有]的程式，轉變為[沒有]！(需要重做瘦身工作
若升級的版本不是已root的，還原備份也不會變成[已root]！
三清後刷機，除了是使用錯誤的Rom，或是刷機程式，基本上是不會FC的