救護車一到醫院門口，救護人員就急忙把傷者送進急診救治。
3日上午10時，中科院九鵬基地推研廠傳出推進劑製程餘藥銷毀作業，因不明原因發生燃燒，4名人員身體受到燒燙傷，趕緊送到屏東南門醫院、恆春基督教醫院跟恆春旅遊醫院救治；隨後國軍人員趕赴醫院將傷患接走。
4名傷者陸續轉送到高雄左營、南部最早成立燒傷中心的國軍高雄總醫院左營分院接受治療。1位輕傷收治普通病房，另外3人傷勢較重，分別有40%、60%及95%燒燙傷。
國軍高雄總醫院左營分院院長洪恭誠指出，「初步評估是95%，就是深2度到3度。95%應該說是極度危險，這幾天都是他的關鍵期，我們會盡全院的力量救治。」
總統府表示，國防部長邱國正在第一時間向蔡英文總統報告，總統指示全力協助救治。由於推進劑燃燒速度快、溫度可達攝氏2000度以上，容易導致嚴重燒燙傷。
中科院化學所所長余鳳兒說明，「一般來講，推進劑的溫度將近2000、3000度，我們一般的防焰服，能抵抗的就是一般的火焰，可能是800到1000度以內。所以你穿在身上的防焰服，其實老實講，有時候是擋不住的。」
余鳳兒表示，當時4人正在進行布線作業，還沒接電；不過在布線過程中，因不明原因廢料閃燃燒起來。詳細事發原因，還有待中科院全面深入鑑定調查。
